在罐藏食品高温杀菌工作过程中，杀菌的主要对象是肉毒芽孢螺旋杆菌，此种菌能产生对人体造成致命伤害的毒素，其属耐热性厌氧菌，在121℃环境中三分将钟将失去生物活性，在100℃环境中6个小时左右失去生物活性。当然，温度越高，该病菌存活时间越短。经科学检测，在121℃时杀菌较为适宜，此时包装物有很好的耐热性，而且食品口感也较为良好。121℃杀菌时，食品中心F值达到4，食品中就不会检测出肉毒芽孢螺旋杆菌，达到了商业无菌的要求。
杀菌锅的作用是为罐藏食品的高温杀菌提供环境，能在指定的温度、时间和压力下对食品进行高温杀菌，其必须有很好的热分布性，即在杀菌时，容器内的任意一点温度与平均温度相差值应符合要求。如果某点的温度低于平均温度，那么该点就不能达到预定的杀菌F值，这个点附近的食品就无法达到杀菌要求。热分布均匀是衡量杀菌锅质量的重要技术指标，可以通过热分布测定仪对其进行测定评估。
食品在高温环境下，时间越长口感越差，营养流失越多，这就要求杀菌锅内各点在升温时温度必须迅速达到一致，保持各点F值高度一致，这样才能迅速结束杀菌过程。降温也要迅速，以便使食品在尽量短的时间内脱离高温环境，这就要求杀菌锅的水流设计要科学合理，较限度减少杀菌时间。
玉米杀菌锅 的工作原理：
杀菌原理是通过热水罐内121℃的杀菌水注入锅内（中和后温度在100-110℃），完全浸泡全部食品，在杀菌软化水不断循环的同时，纯净蒸汽（蒸汽压力0.4-0.6Mpa）直接给锅内的杀菌软化水加热（必要时补充压缩空气），升温迅速（在食品初温25℃左右时，只需要8-15min就能达到121℃），这样既保证了在设定温度下的杀菌，而且不会出现涨袋的现象。能在较的时间内加工出质量好的产品。
该杀菌锅直接用蒸汽升温，直接用常温软化水降温，柔和的多阶段杀菌工艺直观可控，升温迅速，降温时快捷，保证了产品能够在较的时间内达到预定的杀菌效果。
压缩空气可以在整个的加工处理循环过程中使用。它可以程序化地按照工艺要求，通过自动调节阀门进行加压与减压。
玉米杀菌锅 的杀菌处理过程：
当产品进入杀菌锅，杀菌锅门被关闭和锁紧的时候，热水罐内的杀菌水通过自动阀门开启进入杀菌锅，开始整个杀菌过程。这种预先编程的过程循环有如下阶段组成：
1）、升温阶段
◆开启水循环阀门：杀菌软化水通过热水罐进入杀菌锅，使得产品完全被浸泡。
◆同时开启循环泵，使得杀菌水往复循环。
◆同时打开蒸汽阀门，通过锅内蒸汽扩散管对杀菌软化水加热，并达到预定的121℃。
◆蒸汽的进入升温使电脑通过温度传感器的信号传递出现温度的分布曲线。
◆杀菌锅内压力的控制使电脑中出现压力的分布曲线。
◆蒸气冷凝水被排放（通过排水阀与液位计）以保持正常的水位。
2）、杀菌阶段（保温阶段）
◆温度和压力是通过自动阀门控制。通过控制蒸气流量来保证温度为121℃，通过控制压缩空气流量来保持恒压。
◆纯净蒸气注入与杀菌软化水的往复循环结合可以达到的温度分布。水位通过水位探头进行不断的监测，蒸汽冷凝水会通过排水阀的排放保持正常工作水位。
◆温度通过自动的蒸气调节阀被控制在±0.5℃的范围之内。
◆压力通过压缩空气进气阀与排气阀被控制在±0.02Mpa的范围之内。
3）、降温阶段（通过降温软化水直接冷却）
◆降温根据产品外包装的材质不同，可以进行分阶段降温。分阶段降温是为了避免温度突然下降（比如25℃的降温软化水进入杀菌锅给121℃的产品降温）或受到热冲击，避免容器的损坏（如：玻璃瓶、塑料容器)。而软包装和金属容器可以实现直接注入降温软化水降温。
◆冷水阀开启，给水泵启动可以按照预先设定好的温度曲线来快速的冷却产品。
◆同时压缩空气会按照预定的压力曲线来自动的控制。
4）、杀菌结束
◆在降温完成后，释放杀菌锅内的压力，结束信号发出，操作员可以开门出货。